Enhanced recombinase polymerase amplification via UvsX engineering and reaction optimization for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus
Rekombinaza polimeraza amplifikatsiyasi (RPA) kuchli izotermik nuklein kislotani kuchaytirish usuli bo'lib, uning samaradorligi rekombinaza UvsX ning katalitik samaradorligiga juda bog'liq bo'lib, u gomologik DNK juftlashuvi va zanjir almashinuvida vositachilik qiluvchi asosiy ferment hisoblanadi. Ushbu cheklovni bartaraf etish uchun biz ushbu tadqiqotda oqsil muhandisligi orqali UvsX fermentini optimallashtirish va RPA reaksiya tizimini takomillashtirish orqali RPA ni aniqlashning o'ziga xos, sezgir va mustahkam usulini ishlab chiqdik. 13 ta Myoviridae fagidan UvsX ortologlarini qiyosiy strukturaviy va funktsional tahlil qilish orqali biz T4 UvsX ning Loop 2 domenidagi rekombinaza faolligining muhim omillarini aniqladik.Bizning natijalarimiz shuni ko'rsatdiki, ishlab chiqilgan UvsXv1 varianti ipni siljitish faolligini sezilarli darajada yaxshilagan, bu esa RPA kuchaytirish samaradorligi va barqarorligini oshirishga olib keldi.o'ta o'limga olib keladigan Vibrio parahaemolyticusni aniqlash uchun lateral oqim chiziqlari bilan birlashtirildi. Bizning natijalarimiz shuni ko'rsatdiki, ishlab chiqilgan UvsXv1 varianti ipni siljitish faolligini sezilarli darajada yaxshilagan, bu esa RPA kuchaytirish samaradorligi va barqarorligini oshirishga olib keldi.
Obuna bo'lish uchun tizimga kiring
Nashrning boshqa sonlari